De retour à Tree Hill après une semaine en Europe, Nathan est enlevé à l'aéroport. Lorsqu'il apprend qu'il a été enlevé parce qu'il a échoué à signer son joueur, Nathan rentre en conflit avec son kidnappeur, Dimitri. Ce dernier lui annonce alors que lorsque le téléphone sonnera, Nathan sera mort.
Dan se rachète un peu avant sa mort en sauvant la vie de son fils, Nathan Scott, enlevé par un gang. Il sacrifie sa vie pour lui et Nathan, bien que ne lui pardonnant pas l'assassinat de son oncle lui avoue qu'il l'aime et qu'il le remercie.
Dans la saison 6 des Frères Scott, les spectateurs découvrent avec stupeur que c'est en réalité Carrie, la baby-sitter dérangée de Jamie, qui a renversé Dan. Elle l'a d'ailleurs kidnappé et le retient en otage dans une maison isolée près des bois. Tous les jours, elle le torture un peu plus.
Nathan réussit à sauver Cooper et Rachel. Cette dernière tente alors de se rapprocher de lui mais Nathan lui annonce qu'elle n'a aucune chance.
Keith Scott est le fiancé de Karen Roe la mère de Lucas Scott. Il meurt tragiquement lorsque son frère Dan Scott le tue lorsqu'un élève rentre armé d'un pistolet dans le lycée.
En vérité, que les téléspectateurs se rassurent : Nathan sera rapidement retrouvé et cette absence ne sera que de courte durée. Les tenants et les aboutissants de cette mystérieuse disparition auront des répercussions certaines jusqu'à la fin de la neuvième et dernière saison des Frères Scott.
Or, Haley découvre qu'elle est enceinte dans l'épisode 5 de cette même saison. La jeune femme perd ensuite les eaux lors de la remise des diplômes. Cela signifie donc que Jamie est probablement né en mai, au moment où la plupart des lycées organisent leur cérémonie de fin d'année.
À la fin de la saison, lors du re-mariage de Haley et Nathan (en fait simple cérémonie, car lors de leur mariage, seuls les parents d'Haley étaient présents et ils veulent à présent faire une nouvelle cérémonie devant tous leurs amis), Dan apprend que la personne qui a tenté de le tuer n'est pas Keith mais Deborah, son ...
Elle proposa à Nathan et sa femme Haley James ainsi qu'à l'agent de Nathan, Clayton Evans de dire au monde entier qu'elle avait menti en échange d'une grosse somme d'argent, mais les Scott ainsi que Clay refusèrent. Nathan assurant à tout le monde que jamais il ne tromperait Haley.
Dans les dernières saisons, à cause de blessures qui se réveillent, Nathan décide d'arrêter sa carrière, pour devenir agent sportif, en compagnie de Clay.
Haley et Lucas devaient sortir ensemble
“Je pense que c'est ce qu'ils voulaient faire à l'origine, “ a-t-elle expliqué. “Mais Chad et moi n'avions aucune alchimie, donc ça n'a pas marché. Notre énergie était tellement fraternelle qu'ils ont décidé d'abandonner l'idée.”
Les Frères Scott : les adieux de Nathan et Lucas, la mort de Dan, la fin d'une histoire, Gossip Girl rappelée par TFX. C'est la fin pour les célèbres Frères Scott de TFX. En diffusant le 187e et ultime épisode de la série culte, la chaine du groupe TF1 tourne la page et relance Gossip Girl dès le 10 février.
Dès le 1er épisode Brooke quitte Lucas en lui disant qu'elle a l'impression qu'elle ne lui manque pas, et que de ce fait il a cessé de lui manquer. Ils ne passent pas beaucoup de temps ensemble, elle lui en veut toujours et pense qu'il est avec Peyton.
Nathan est sauvé de l'accident par Lucas. Quand Haley et lui rentre à l'appartement, il lui demande ce qu'elle voulait lui dire de très important. Haley lui dit qu'elle a été acceptée à Stanford. Il est très content pour elle.
Une nouvelle vie de famille pour Clay et Quinn
À l'issue du dernier épisode de la neuvième saison, Quinn et Clay décident de sauter le pas en se mariant. Par la suite, ils signent les papiers d'adoption de Logan, dont les anciens beaux-parents de ce dernier avaient jusqu'alors la garde.
Finalement, Nathan et Haley sortent ensemble au bout de quelques mois, et se marient en cachette à la fin de la saison alors qu'ils ne sont âgés que de 16 ans.
Saison 4. Au début de la saison 4, il semble que ce soit Brooke qui est enceinte. Lucas prend mal le fait qu'elle ne lui ait pas annoncé la nouvelle. Il s'avère finalement que c'est Haley qui attend un enfant de Nathan Scott, le demi-frère de Lucas.
Dan cherche à savoir qui a tenté à sa vie lors de l'incendie. Persuadé que c'est Keith son frère, lors de la prise d'otage dans le lycée, Dan tuera son frère.
Haley découvre qu'elle est enceinte de son premier enfant et l'annonce à Nathan Scott dans l'épisode 5 de la saison 4, soit seulement un épisode avant que Nick dise à Brooke qu'il ne lui reste plus que trois mois d'école.
Eh oui, ce cher Nathan se fait kidnapper dans l'épisode 5 et ensuite n'apparaît que très peu dans ce dernier chapitre de la teen série culte. Cependant, les scénaristes avaient une très bonne raison pour minimiser le temps d'écran de James Lafferty. Mais alors, pourquoi l'acteur est-il moins apparu dans la saison 9 ?
Entre Brooke Davis et Peyton Sawyer, Lucas Scott (joué par Chad Michael Murray) a eu beaucoup de mal à choisir dans Les Frères Scott. Mais dans la vraie vie, c'est la belle Sophia Bush que l'acteur a choisi d'épouser. Après s'être rencontrés sur le tournage de la série phénomène, ils décident de se mettre en couple.
Nathan parvient à sauver Rachel et Cooper et se sort de l'accident, il est persuadé avoir vu Keith sous l'eau.
La fin de la saison 6 des Frères Scott marque un tournant avec les départs de Chad Michael Murray aka Lucas Scott et Hilarie Burton aka Peyton Sawyer.
Mais voilà, dans l'épisode 11 de la saison 4, Lucas se rend sur les tombes de Jimmy ET Keith, et l'on s'aperçoit qu'il n'y a pas la même date sur les deux. Ainsi, il est écrit que Keith est mort le 23 janvier 2006, mais que Jimmy est décédé le 1er mars 2006.